Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms