Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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