Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt27Q9Z320 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms