Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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