Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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