Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms