Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W4

Gdf11, Growth/differentiation factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf11Q9Z1W4 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gdf11Q9Z1W4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gdf11Q9Z1W4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf11Q9Z1W4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gdf11Q9Z1W4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gdf11Q9Z1W4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gdf11Q9Z1W4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf11Q9Z1W4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf11Q9Z1W4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf11Q9Z1W4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gdf11Q9Z1W4 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf11Q9Z1W4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gdf11Q9Z1W4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gdf11Q9Z1W4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gdf11Q9Z1W4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf11Q9Z1W4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gdf11Q9Z1W4 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gdf11Q9Z1W4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf11Q9Z1W4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf11Q9Z1W4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf11Q9Z1W4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf11Q9Z1W4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf11Q9Z1W4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf11Q9Z1W4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf11Q9Z1W4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf11Q9Z1W4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf11Q9Z1W4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf11Q9Z1W4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf11Q9Z1W4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf11Q9Z1W4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gdf11Q9Z1W4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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