Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms