Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ccl8Q9Z121 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ccl8Q9Z121 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ccl8Q9Z121 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ccl8Q9Z121 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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