Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z101

Pard6a, Partitioning defective 6 homolog alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6aQ9Z101 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pard6aQ9Z101 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pard6aQ9Z101 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms