Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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