Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trpc2Q9R244 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trpc2Q9R244 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trpc2Q9R244 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trpc2Q9R244 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trpc2Q9R244 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trpc2Q9R244 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Trpc2Q9R244 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Trpc2Q9R244 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Trpc2Q9R244 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Trpc2Q9R244 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Trpc2Q9R244 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trpc2Q9R244 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trpc2Q9R244 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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