Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms