Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim44Q9QXA7 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim44Q9QXA7 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim44Q9QXA7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim44Q9QXA7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim44Q9QXA7 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim44Q9QXA7 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim44Q9QXA7 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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