Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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