Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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