Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Trim39Q9ESN2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Trim39Q9ESN2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Trim39Q9ESN2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Trim39Q9ESN2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim39Q9ESN2 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Trim39Q9ESN2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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