Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp29Q9ES63 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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