Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Wdr61Q9ERF3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms