Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms