Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Rnft1Q9DCN7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Rnft1Q9DCN7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Rnft1Q9DCN7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms