Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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