Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ccdc97Q9DBT3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ccdc97Q9DBT3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ccdc97Q9DBT3 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ccdc97Q9DBT3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ccdc97Q9DBT3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ccdc97Q9DBT3 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ccdc97Q9DBT3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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