Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms