Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Cldn34b2Q9D9N2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Cldn34b2Q9D9N2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Cldn34b2Q9D9N2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Cldn34b2Q9D9N2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Cldn34b2Q9D9N2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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