Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pdzd9Q9D9M4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pdzd9Q9D9M4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pdzd9Q9D9M4 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pdzd9Q9D9M4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pdzd9Q9D9M4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pdzd9Q9D9M4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pdzd9Q9D9M4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms