Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn9Q9D805 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms