Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.3 ms