Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Nop56Q9D6Z1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Nop56Q9D6Z1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Nop56Q9D6Z1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Nop56Q9D6Z1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Nop56Q9D6Z1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Nop56Q9D6Z1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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Nop56Q9D6Z1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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