Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms