Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pus10Q9D3U0 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pus10Q9D3U0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pus10Q9D3U0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pus10Q9D3U0 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pus10Q9D3U0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pus10Q9D3U0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pus10Q9D3U0 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pus10Q9D3U0 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pus10Q9D3U0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pus10Q9D3U0 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pus10Q9D3U0 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pus10Q9D3U0 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pus10Q9D3U0 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms