Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed11Q9D2R4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed11Q9D2R4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed11Q9D2R4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed11Q9D2R4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed11Q9D2R4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed11Q9D2R4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed11Q9D2R4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed11Q9D2R4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed11Q9D2R4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed11Q9D2R4 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed11Q9D2R4 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed11Q9D2R4 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed11Q9D2R4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed11Q9D2R4 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed11Q9D2R4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms