Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snapc3Q9D2C9 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms