Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Trappc6bQ9D289 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Trappc6bQ9D289 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Trappc6bQ9D289 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Trappc6bQ9D289 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Trappc6bQ9D289 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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