Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Spns3Q9D232 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Spns3Q9D232 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Spns3Q9D232 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Spns3Q9D232 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Spns3Q9D232 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Spns3Q9D232 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Spns3Q9D232 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Spns3Q9D232 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Spns3Q9D232 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spns3Q9D232 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spns3Q9D232 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Spns3Q9D232 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spns3Q9D232 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spns3Q9D232 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spns3Q9D232 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spns3Q9D232 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spns3Q9D232 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spns3Q9D232 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spns3Q9D232 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Spns3Q9D232 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Spns3Q9D232 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spns3Q9D232 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spns3Q9D232 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms