Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc47Q9D024 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc47Q9D024 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc47Q9D024 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc47Q9D024 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc47Q9D024 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc47Q9D024 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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