Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Snf8Q9CZ28 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Snf8Q9CZ28 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Snf8Q9CZ28 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Snf8Q9CZ28 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Snf8Q9CZ28 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Snf8Q9CZ28 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Snf8Q9CZ28 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms