Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms