Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms