Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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