Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms