Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Atp6v0e1Q9CQD8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Atp6v0e1Q9CQD8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Atp6v0e1Q9CQD8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Atp6v0e1Q9CQD8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Atp6v0e1Q9CQD8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Atp6v0e1Q9CQD8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Atp6v0e1Q9CQD8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Atp6v0e1Q9CQD8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Atp6v0e1Q9CQD8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Atp6v0e1Q9CQD8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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