Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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