Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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