Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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