Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms