Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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