Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc8b1Q925Q3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms