Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Rnf144aQ925F3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Rnf144aQ925F3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Rnf144aQ925F3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Rnf144aQ925F3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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