Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Myo1c-202ENSMUST00000102504 4659 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 1500004A13Rik-202ENSMUST00000183707 6054 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Emc1-202ENSMUST00000082262 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Plec-207ENSMUST00000076442 15439 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Ank3-206ENSMUST00000092434 5886 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Tenm1-201ENSMUST00000016294 8365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Map2-206ENSMUST00000114017 4981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Plxna4-201ENSMUST00000115096 12877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Prpf8-202ENSMUST00000102510 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Olfr914-202ENSMUST00000217057 4948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Cdk12-201ENSMUST00000003203 4837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Prickle2-203ENSMUST00000113446 7860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Myo7b-201ENSMUST00000134663 6621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Akap2-202ENSMUST00000098064 7172 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Olfr1219-205ENSMUST00000217421 5849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Tsc1-203ENSMUST00000113869 7702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms